Η Δρ. Μάργαρη είναι Κύρια Ερευνήτρια του Κέντρου Ερεύνης της Ελληνικής Λαογραφίας της Ακαδημίας Αθηνών. Πραγματοποίησε σπουδές στην Εθνολογία, Ανθρωπολογία και Κινησιολογία, με εστίαση στην Εθνοχορολογία. Εξειδικεύεται στην μελέτη των άυλων εκφάνσεων του λαϊκού πολιτισμού, με έμφαση στην εθνοανθρωπολογική προσέγγιση των λαϊκών δρωμένων και του χορού. Έχει πραγματοποιήσει εκτεταμένη επιτόπια έρευνα στην Ελλάδα και το εξωτερικό. Τα ερευνητικά της ενδιαφέροντα εντάσσονται στα πεδία των λαογραφικών και ανθρωπολογικών σπουδών του πολιτισμού, με έμφαση στην πολυπρισματική μελέτη της επιτέλεσης και της διασύνδεσής της με την θεωρία και τις πρακτικές της συγκρότησης των πολιτισμικών ταυτοτικών μορφωμάτων και της πολιτισμικής/πολιτιστικής κληρονομιάς σε τοπικά/εθνικά/διεθνή συμφραζόμενα. Με την εν λόγω εστίαση έχει συμμετάσχει ως Επιστημονική Συνεργάτις-Ερευνήτρια-Διευθύντρια Ερευνών, στον σχεδιασμό και την υλοποίηση πολλών ανάλογων εθνικών-διακρατικών ερευνητικών προγραμμάτων/έργων.
Παράλληλα, από το 1999 έως σήμερα, διδάσκει στο πλαίσιο προπτυχιακών/μεταπτυχιακών προγραμμάτων σπουδών πολλών Ανώτατων Εκπαιδευτικών Ιδρυμάτων (ΕΑΠ, ΕΚΠΑ, ΕΣΔΔΑ, κ.ά.), ενώ ταυτόχρονα δραστηριοποιείται στην ανάπτυξη εκπαιδευτικών προγραμμάτων με αντικείμενο τον πολιτισμό, την ανθρωποκεντρική μελέτη και την αειφόρο διαχείρισή του. Με αυτή την συλλογιστική, διετέλεσε επιστημονική συνεργάτις/διδάσκουσα (1999-2002) και Καθηγήτρια Εφαρμογών (2002-2009) του Τμήματος Λαϊκής και Παραδοσιακής Μουσική του ΑΤΕΙ Ηπείρου, στην επιστημονική ομάδα ίδρυσης του οποίου συμμετείχε.
Η Δρ. Μάργαρη έχει λάβει μέρος σε ελληνικά-διεθνή συνέδρια και έχει δημοσιεύσει βιβλία και άρθρα σε ελληνικά και ξένα επιστημονικά περιοδικά παρουσιάζοντας εθνογραφικές-θεωρητικές μελέτες, με αντικείμενο την σύγχρονη εθνοανθρωπολογική προσέγγιση του λαϊκού πολιτισμού. Διετέλεσε, από ιδρύσεως, μέλος της Εθνικής Επιστημονικής Επιτροπής για την Εφαρμογή της Σύμβασης για την Προστασία της Άυλης Πολιτιστικής Κληρονομιάς (2012-2024), ενώ από συστάσεως διατελεί μέλος του Συμβουλίου Άυλης Κληρονομιάς που την διαδέχθηκε (2025-σήμερα) καθώς και έξι ακόμη επιστημονικών ομάδων εργασίας διεθνών επιστημονικών φορέων-οργανισμών με αντικείμενο την ανθρωπολογική προσέγγιση των επιτελεστικών πολιτισμικών πρακτικών.