- Κέντρον Ερεύνης των Νεοελληνικών Διαλέκτων και Ιδιωμάτων – Ι.Λ.Ν.Ε.
- Κέντρον Ερεύνης της Ελληνικής Λαογραφίας
- Κέντρον Ερεύνης του Μεσαιωνικού και Νέου Ελληνισμού
- Κέντρον Ερεύνης της Ιστορίας του Ελληνικού Δικαίου
- Κέντρον Ερεύνης της Ιστορίας του Νεωτέρου Ελληνισμού
- Κέντρον Ερεύνης της Ελληνικής και Λατινικής Γραμματείας
- Κέντρον Ερευνών Αστρονομίας και Εφηρμοσμένων Μαθηματικών
- Κέντρον Ερεύνης της Ελληνικής Φιλοσοφίας
- Κέντρον Ερεύνης Επιστημονικών Όρων και Νεολογισμών
- Κέντρον Ερεύνης Φυσικής της Ατμοσφαίρας και Κλιματολογίας
- Κέντρον Ερεύνης της Αρχαιότητος
- Κέντρον Ερεύνης της Ελληνικής Κοινωνίας
- Κέντρο Έρευνας της Βυζαντινής και Μεταβυζαντινής Τέχνης
- Κέντρο Ερευνών Θεωρητικών και Εφηρμοσμένων Μαθηματικών
- Κέντρο Έρευνας και Εκπαίδευσης στη Δημόσια Υγεία
- Κέντρο Διαστημικής Έρευνας και Τεχνολογίας
- Κέντρο Έρευνας Φυσικών Καταστροφών και Διαχείρισης Κρίσεων
